Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 NQM1YGR043C 1002 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 YGR122WYGR122W 1209 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 YGR137WYGR137W 375 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 YML003WYML003W 873 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 BUD17YNR027W 954 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 MIX23YBL107C 591 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 CDC21YOR074C 915 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 PUP1YOR157C 786 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 YPL257WYPL257W 582 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 HOG1YLR113W 1308 nt6.42□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 GUT1YHL032C 2130 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 UTP5YDR398W 1932 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 SDS24YBR214W 1584 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 MRPL35YDR322W 1104 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 YER156CYER156C 1017 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 TYW3YGL050W 822 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 FMP48YGR052W 1110 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 YGR126WYGR126W 693 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 YGR290WYGR290W 444 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 NAS2YIL007C 663 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 YJR141WYJR141W 1044 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 COQ9YLR201C 783 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 VPS21YOR089C 633 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 MCA1YOR197W 1299 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 YMR034CYMR034C 1305 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 TRM1YDR120C 1713 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 UTR2YEL040W 1404 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 SPS1YDR523C 1473 nt6.41□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 YLL066CYLL066C 3618 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 URK1YNR012W 1506 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 GAS2YLR343W 1668 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 YCR041WYCR041W 333 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 COS12YGL263W 1143 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 YHR173CYHR173C 339 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 RSM7YJR113C 744 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 COS1YNL336W 1146 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 MET22YOL064C 1074 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 MHF1YOL086W-A 273 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 YPL073CYPL073C 486 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 ARR3YPR201W 1215 nt6.4□□□□□ -1.38
TY1A-DR3Q12441 KTR6YPL053C 1341 nt6.4□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 ATG7YHR171W 1893 nt6.4□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 RAD57YDR004W 1383 nt6.4□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 STE12YHR084W 2067 nt6.4□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 PYK2YOR347C 1521 nt6.4□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 CLN1YMR199W 1641 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 PDC6YGR087C 1692 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 GSH1YJL101C 2037 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 KIN28YDL108W 921 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 MMF1YIL051C 438 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 YKL147CYKL147C 618 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 YKR047WYKR047W 306 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 RIM11YMR139W 1113 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 TRI1YMR233W 681 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 YBL094CYBL094C 333 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 SPE2YOL052C 1191 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 SLG1YOR008C 1137 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 YOR199WYOR199W 330 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 CAR1YPL111W 1002 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 FDH2YPL275W 711 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 RPT2YDL007W 1314 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 YTM1YOR272W 1383 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 MSG5YNL053W 1470 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 GSH2YOL049W 1476 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 VMA2YBR127C 1554 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 EMP65YER140W 1671 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 NSE5YML023C 1671 nt6.39□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 BUG1YDL099W 1026 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 NIF3YGL221C 867 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 RPF1YHR088W 888 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 NTG1YAL015C 1200 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 VMA5YKL080W 1179 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 YKR012CYKR012C 378 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 YLR112WYLR112W 420 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 CDD1YLR245C 429 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 PRM3YPL192C 402 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 RNY1YPL123C 1305 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 MFG1YDL233W 1377 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 RKM2YDR198C 1440 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 STP4YDL048C 1473 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 VPS30YPL120W 1674 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 GUP2YPL189W 1830 nt6.38□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 NOP8YOL144W 1455 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 IDS2YJL146W 1410 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 VPS4YPR173C 1314 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 YGL117WYGL117W 798 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 CYC1YJR048W 330 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 AAD10YJR155W 867 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 YAR053WYAR053W 297 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 ADD37YMR184W 597 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 PUS4YNL292W 1212 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 YOR263CYOR263C 408 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 OXR1YPL196W 822 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 RPS9BYBR189W 588 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 GLN3YER040W 2193 nt6.37□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 HSM3YBR272C 1443 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 IML2YJL082W 2196 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 YDR215CYDR215C 414 nt6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.1 ms