Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBE3AQ05086 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBE3AQ05086 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms