Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 RKM2YDR198C 1440 nt5.03□□□□□ -1.6
SEC28P40509 ADE6YGR061C 4077 nt5.03□□□□□ -1.6
SEC28P40509 ALD3YMR169C 1521 nt5.02□□□□□ -1.61
SEC28P40509 ALD2YMR170C 1521 nt5.02□□□□□ -1.61
SEC28P40509 ADE4YMR300C 1533 nt5.02□□□□□ -1.61
SEC28P40509 MHF2YDL160C-A 243 nt5.02□□□□□ -1.61
SEC28P40509 INO2YDR123C 915 nt5.02□□□□□ -1.61
SEC28P40509 YLR036CYLR036C 612 nt5.02□□□□□ -1.61
SEC28P40509 YMR082CYMR082C 357 nt5.02□□□□□ -1.61
SEC28P40509 COX11YPL132W 903 nt5.02□□□□□ -1.61
SEC28P40509 YPR109WYPR109W 885 nt5.02□□□□□ -1.61
SEC28P40509 ARR1YPR199C 885 nt5.02□□□□□ -1.61
SEC28P40509 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt5.02□□□□□ -1.61
SEC28P40509 MUM3YOR298W 1440 nt5.02□□□□□ -1.61
SEC28P40509 CPS1YJL172W 1731 nt5.02□□□□□ -1.61
SEC28P40509 PDI1YCL043C 1569 nt5.01□□□□□ -1.61
SEC28P40509 YDL183CYDL183C 963 nt5.01□□□□□ -1.61
SEC28P40509 UBC1YDR177W 648 nt5.01□□□□□ -1.61
SEC28P40509 YMR147WYMR147W 672 nt5.01□□□□□ -1.61
SEC28P40509 YPR150WYPR150W 522 nt5.01□□□□□ -1.61
SEC28P40509 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt5.01□□□□□ -1.61
SEC28P40509 APM2YHL019C 1818 nt5.01□□□□□ -1.61
SEC28P40509 TFG1YGR186W 2208 nt5.01□□□□□ -1.61
SEC28P40509 ALG2YGL065C 1512 nt5.01□□□□□ -1.61
SEC28P40509 RAD57YDR004W 1383 nt5.01□□□□□ -1.61
SEC28P40509 DAL3YIR032C 588 nt5□□□□□ -1.61
SEC28P40509 HLJ1YMR161W 675 nt5□□□□□ -1.61
SEC28P40509 SFT2YBL102W 648 nt5□□□□□ -1.61
SEC28P40509 BRE2YLR015W 1518 nt5□□□□□ -1.61
SEC28P40509 EKI1YDR147W 1605 nt5□□□□□ -1.61
SEC28P40509 HOS2YGL194C 1359 nt5□□□□□ -1.61
SEC28P40509 FRE3YOR381W 2136 nt5□□□□□ -1.61
SEC28P40509 SFI1YLL003W 2841 nt5□□□□□ -1.61
SEC28P40509 FRE1YLR214W 2061 nt5□□□□□ -1.61
SEC28P40509 YTA6YPL074W 2265 nt4.99□□□□□ -1.61
SEC28P40509 DOA1YKL213C 2148 nt4.99□□□□□ -1.61
SEC28P40509 MCH4YOL119C 1506 nt4.99□□□□□ -1.61
SEC28P40509 ACT1YFL039C 1128 nt4.99□□□□□ -1.61
SEC28P40509 SEH1YGL100W 1050 nt4.99□□□□□ -1.61
SEC28P40509 CUS2YNL286W 858 nt4.99□□□□□ -1.61
SEC28P40509 SAS10YDL153C 1833 nt4.98□□□□□ -1.61
SEC28P40509 MSH1YHR120W 2880 nt4.98□□□□□ -1.61
SEC28P40509 FAP1YNL023C 2898 nt4.98□□□□□ -1.61
SEC28P40509 ROT2YBR229C 2865 nt4.98□□□□□ -1.61
SEC28P40509 YFL064CYFL064C 525 nt4.98□□□□□ -1.61
SEC28P40509 TRX2YGR209C 315 nt4.98□□□□□ -1.61
SEC28P40509 COA2YPL189C-A 207 nt4.98□□□□□ -1.61
SEC28P40509 YPR202WYPR202W 717 nt4.98□□□□□ -1.61
SEC28P40509 ATG32YIL146C 1590 nt4.98□□□□□ -1.61
SEC28P40509 ASA1YPR085C 1332 nt4.97□□□□□ -1.61
SEC28P40509 UBX7YBR273C 1311 nt4.97□□□□□ -1.61
SEC28P40509 THI22YPR121W 1719 nt4.97□□□□□ -1.61
SEC28P40509 HIR2YOR038C 2628 nt4.97□□□□□ -1.61
SEC28P40509 DAL81YIR023W 2913 nt4.97□□□□□ -1.61
SEC28P40509 IMG2YCR071C 441 nt4.97□□□□□ -1.61
SEC28P40509 SPR28YDR218C 1272 nt4.97□□□□□ -1.61
SEC28P40509 NSG1YHR133C 876 nt4.97□□□□□ -1.61
SEC28P40509 LNP1YHR192W 837 nt4.97□□□□□ -1.61
SEC28P40509 MHO1YJR008W 1017 nt4.97□□□□□ -1.61
SEC28P40509 NRG2YBR066C 663 nt4.97□□□□□ -1.61
SEC28P40509 TMN2YDR107C 2019 nt4.97□□□□□ -1.61
SEC28P40509 MAL13YGR288W 1422 nt4.97□□□□□ -1.61
SEC28P40509 BUD22YMR014W 1560 nt4.96□□□□□ -1.62
SEC28P40509 BLM10YFL007W 6432 nt4.96□□□□□ -1.62
SEC28P40509 SLC1YDL052C 912 nt4.96□□□□□ -1.62
SEC28P40509 THI5YFL058W 1023 nt4.96□□□□□ -1.62
SEC28P40509 RPB4YJL140W 666 nt4.96□□□□□ -1.62
SEC28P40509 YLR125WYLR125W 411 nt4.96□□□□□ -1.62
SEC28P40509 YMR245WYMR245W 621 nt4.96□□□□□ -1.62
SEC28P40509 THI12YNL332W 1023 nt4.96□□□□□ -1.62
SEC28P40509 BUB3YOR026W 1026 nt4.96□□□□□ -1.62
SEC28P40509 NAT5YOR253W 531 nt4.96□□□□□ -1.62
SEC28P40509 MET31YPL038W 534 nt4.96□□□□□ -1.62
SEC28P40509 CAB3YKL088W 1716 nt4.96□□□□□ -1.62
SEC28P40509 ABF1YKL112W 2196 nt4.96□□□□□ -1.62
SEC28P40509 NDC1YML031W 1968 nt4.96□□□□□ -1.62
SEC28P40509 YDR134CYDR134C 411 nt4.95□□□□□ -1.62
SEC28P40509 YLR124WYLR124W 345 nt4.95□□□□□ -1.62
SEC28P40509 YNL143CYNL143C 393 nt4.95□□□□□ -1.62
SEC28P40509 YNG1YOR064C 660 nt4.95□□□□□ -1.62
SEC28P40509 YPL073CYPL073C 486 nt4.95□□□□□ -1.62
SEC28P40509 BBP1YPL255W 1158 nt4.95□□□□□ -1.62
SEC28P40509 QCR2YPR191W 1107 nt4.95□□□□□ -1.62
SEC28P40509 ERG4YGL012W 1422 nt4.95□□□□□ -1.62
SEC28P40509 CLD1YGR110W 1338 nt4.95□□□□□ -1.62
SEC28P40509 SEG2YKL105C 3399 nt4.95□□□□□ -1.62
SEC28P40509 KCC4YCL024W 3114 nt4.94□□□□□ -1.62
SEC28P40509 RSC6YCR052W 1452 nt4.94□□□□□ -1.62
SEC28P40509 TRS23YDR246W 660 nt4.94□□□□□ -1.62
SEC28P40509 RPL28YGL103W 450 nt4.94□□□□□ -1.62
SEC28P40509 PRM9YAR031W 897 nt4.94□□□□□ -1.62
SEC28P40509 ZPS1YOL154W 750 nt4.94□□□□□ -1.62
SEC28P40509 ARO7YPR060C 771 nt4.94□□□□□ -1.62
SEC28P40509 UBA3YPR066W 900 nt4.94□□□□□ -1.62
SEC28P40509 MTC1YJL123C 1437 nt4.94□□□□□ -1.62
SEC28P40509 LEU1YGL009C 2340 nt4.94□□□□□ -1.62
SEC28P40509 TRE1YPL176C 2352 nt4.93□□□□□ -1.62
SEC28P40509 STE7YDL159W 1548 nt4.93□□□□□ -1.62
SEC28P40509 TDA11YHR159W 1515 nt4.93□□□□□ -1.62
SEC28P40509 SET4YJL105W 1683 nt4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 75.1 ms