Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MSCO60682 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MSCO60682 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
MSCO60682 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MSCO60682 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSCO60682 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSCO60682 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSCO60682 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSCO60682 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSCO60682 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSCO60682 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSCO60682 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSCO60682 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSCO60682 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MSCO60682 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSCO60682 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSCO60682 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSCO60682 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSCO60682 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSCO60682 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MSCO60682 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSCO60682 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSCO60682 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSCO60682 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSCO60682 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSCO60682 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSCO60682 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSCO60682 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSCO60682 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MSCO60682 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSCO60682 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSCO60682 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSCO60682 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MSCO60682 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSCO60682 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSCO60682 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSCO60682 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSCO60682 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSCO60682 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSCO60682 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSCO60682 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSCO60682 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSCO60682 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSCO60682 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSCO60682 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSCO60682 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSCO60682 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSCO60682 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSCO60682 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSCO60682 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSCO60682 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSCO60682 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSCO60682 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSCO60682 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSCO60682 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSCO60682 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSCO60682 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSCO60682 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSCO60682 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSCO60682 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSCO60682 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MSCO60682 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MSCO60682 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSCO60682 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSCO60682 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSCO60682 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSCO60682 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSCO60682 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSCO60682 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSCO60682 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSCO60682 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSCO60682 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSCO60682 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MSCO60682 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSCO60682 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSCO60682 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSCO60682 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSCO60682 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSCO60682 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSCO60682 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSCO60682 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSCO60682 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSCO60682 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSCO60682 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSCO60682 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSCO60682 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSCO60682 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSCO60682 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSCO60682 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MSCO60682 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MSCO60682 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSCO60682 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSCO60682 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSCO60682 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSCO60682 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSCO60682 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MSCO60682 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSCO60682 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSCO60682 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSCO60682 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms