Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RASA4O43374 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RASA4O43374 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RASA4O43374 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RASA4O43374 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RASA4O43374 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RASA4O43374 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RASA4O43374 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RASA4O43374 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RASA4O43374 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RASA4O43374 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RASA4O43374 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RASA4O43374 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RASA4O43374 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RASA4O43374 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASA4O43374 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASA4O43374 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASA4O43374 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASA4O43374 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASA4O43374 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASA4O43374 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASA4O43374 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RASA4O43374 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RASA4O43374 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RASA4O43374 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RASA4O43374 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RASA4O43374 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RASA4O43374 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RASA4O43374 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RASA4O43374 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RASA4O43374 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RASA4O43374 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RASA4O43374 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RASA4O43374 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RASA4O43374 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RASA4O43374 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RASA4O43374 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RASA4O43374 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RASA4O43374 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RASA4O43374 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RASA4O43374 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RASA4O43374 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RASA4O43374 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RASA4O43374 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RASA4O43374 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RASA4O43374 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RASA4O43374 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RASA4O43374 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RASA4O43374 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RASA4O43374 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RASA4O43374 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RASA4O43374 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RASA4O43374 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RASA4O43374 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RASA4O43374 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RASA4O43374 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RASA4O43374 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RASA4O43374 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RASA4O43374 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RASA4O43374 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RASA4O43374 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RASA4O43374 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RASA4O43374 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RASA4O43374 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RASA4O43374 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RASA4O43374 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RASA4O43374 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RASA4O43374 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RASA4O43374 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RASA4O43374 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RASA4O43374 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RASA4O43374 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RASA4O43374 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RASA4O43374 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RASA4O43374 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RASA4O43374 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RASA4O43374 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RASA4O43374 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RASA4O43374 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RASA4O43374 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RASA4O43374 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RASA4O43374 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RASA4O43374 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RASA4O43374 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RASA4O43374 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RASA4O43374 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RASA4O43374 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RASA4O43374 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RASA4O43374 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RASA4O43374 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RASA4O43374 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RASA4O43374 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RASA4O43374 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RASA4O43374 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RASA4O43374 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RASA4O43374 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RASA4O43374 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RASA4O43374 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RASA4O43374 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RASA4O43374 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms