Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TREX1Q9NSU2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TREX1Q9NSU2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms