Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF3Q8N9W5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNAAF3Q8N9W5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAAF3Q8N9W5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms