Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC93Q567U6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms