Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARB2Q14108 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCARB2Q14108 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SCARB2Q14108 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SCARB2Q14108 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCARB2Q14108 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCARB2Q14108 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCARB2Q14108 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCARB2Q14108 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCARB2Q14108 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SCARB2Q14108 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCARB2Q14108 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCARB2Q14108 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCARB2Q14108 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCARB2Q14108 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCARB2Q14108 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCARB2Q14108 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARB2Q14108 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCARB2Q14108 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARB2Q14108 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCARB2Q14108 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARB2Q14108 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARB2Q14108 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARB2Q14108 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARB2Q14108 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCARB2Q14108 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCARB2Q14108 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCARB2Q14108 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCARB2Q14108 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCARB2Q14108 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCARB2Q14108 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCARB2Q14108 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCARB2Q14108 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCARB2Q14108 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
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