Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 VPS72YDR485C 2388 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 SPO1YNL012W 1896 nt7.21□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 FCY21YER060W 1587 nt7.21□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 MKS1YNL076W 1755 nt7.21□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 TPI1YDR050C 747 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 RIB3YDR487C 627 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 RPL24AYGL031C 468 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 SNO1YMR095C 675 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 IGO1YNL157W 507 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 SWT21YNL187W 1074 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 YBL095WYBL095W 813 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 SHE3YBR130C 1278 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 THI3YDL080C 1830 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 ORC5YNL261W 1440 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 YMR1YJR110W 2067 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 TSC13YDL015C 933 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 PEX10YDR265W 1014 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 HLR1YDR528W 1272 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 PUS6YGR169C 1215 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 BUD32YGR262C 786 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 YNR029CYNR029C 1290 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 LEA1YPL213W 717 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 YPL257WYPL257W 582 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 MCH2YKL221W 1422 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 YDR114CYDR114C 303 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 RAD23YEL037C 1197 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 YER134CYER134C 537 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 YAR047CYAR047C 321 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 RPS1AYLR441C 768 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 SPS18YNL204C 903 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 MEI5YPL121C 669 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 GDS1YOR355W 1569 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 YCR015CYCR015C 954 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 CWC2YDL209C 1020 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 HNT2YDR305C 654 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 HOP2YGL033W 657 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 YNK1YKL067W 462 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 ECI1YLR284C 843 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 YOL099CYOL099C 492 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 HAP5YOR358W 729 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 MFG1YDL233W 1377 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 NTA1YJR062C 1374 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 YTM1YOR272W 1383 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 YGL117WYGL117W 798 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 DOT5YIL010W 648 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 HMS2YJR147W 1077 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 ELO3YLR372W 1038 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 YLR444CYLR444C 303 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 HLJ1YMR161W 675 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 PEX15YOL044W 1152 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 SAM4YPL273W 978 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 YPR015CYPR015C 744 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 STL1YDR536W 1710 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 GCD10YNL062C 1437 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 HXT13YEL069C 1695 nt7.16□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 TPM2YIL138C 486 nt7.16□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 YJL147CYJL147C 1149 nt7.16□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 MCM22YJR135C 720 nt7.16□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 YLR217WYLR217W 324 nt7.16□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 DTD1YDL219W 453 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 COX20YDR231C 618 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 SDC1YDR469W 528 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 PGD1YGL025C 1194 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 NQM1YGR043C 1002 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 JLP1YLL057C 1239 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 YBL059WYBL059W 582 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 CRC1YOR100C 984 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 CST26YBR042C 1194 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 MRP51YPL118W 1035 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 YPL185WYPL185W 396 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 YPR197CYPR197C 564 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1A-BRQ12217 GLO3YER122C 1482 nt7.15□□□□□ -1.27
TY1A-BRQ12217 IME4YGL192W 1803 nt7.15□□□□□ -1.27
TY1A-BRQ12217 ECM10YEL030W 1935 nt7.15□□□□□ -1.27
TY1A-BRQ12217 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-BRQ12217 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-BRQ12217 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-BRQ12217 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-BRQ12217 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-BRQ12217 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-BRQ12217 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-BRQ12217 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-BRQ12217 YER137C-AYER137C-A 1323 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-BRQ12217 YER159C-AYER159C-A 1323 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-BRQ12217 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-BRQ12217 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-BRQ12217 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-BRQ12217 TIM10YHR005C-A 282 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-BRQ12217 DYS1YHR068W 1164 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-BRQ12217 TIM54YJL054W 1437 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-BRQ12217 PRY1YJL079C 900 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-BRQ12217 YJR026WYJR026W 1323 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-BRQ12217 YJR028WYJR028W 1323 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1A-BRQ12217 AAD10YJR155W 867 nt7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 63.9 ms