Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTHFRP42898 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MTHFRP42898 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTHFRP42898 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms