Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ABCB4P21439 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB4P21439 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms