Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.6 ms