Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP9-8Q9BYQ0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms