Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR53Q7Z5U6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR53Q7Z5U6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms