Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4I7

LIMS2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS2Q7Z4I7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIMS2Q7Z4I7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIMS2Q7Z4I7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIMS2Q7Z4I7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIMS2Q7Z4I7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIMS2Q7Z4I7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIMS2Q7Z4I7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIMS2Q7Z4I7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIMS2Q7Z4I7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIMS2Q7Z4I7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIMS2Q7Z4I7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LIMS2Q7Z4I7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIMS2Q7Z4I7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIMS2Q7Z4I7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIMS2Q7Z4I7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIMS2Q7Z4I7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIMS2Q7Z4I7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIMS2Q7Z4I7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIMS2Q7Z4I7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIMS2Q7Z4I7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIMS2Q7Z4I7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIMS2Q7Z4I7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIMS2Q7Z4I7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LIMS2Q7Z4I7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIMS2Q7Z4I7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIMS2Q7Z4I7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIMS2Q7Z4I7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms