Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC158Q5M9N0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC158Q5M9N0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC158Q5M9N0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC158Q5M9N0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC158Q5M9N0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC158Q5M9N0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC158Q5M9N0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC158Q5M9N0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC158Q5M9N0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC158Q5M9N0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC158Q5M9N0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC158Q5M9N0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC158Q5M9N0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms