Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNA1CQ13936 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNA1CQ13936 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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