Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 NMD3YHR170W 1557 nt7.06□□□□□ -1.28
TY2B-BQ12491 YCR085WYCR085W 354 nt7.05□□□□□ -1.28
TY2B-BQ12491 YJL215CYJL215C 360 nt7.05□□□□□ -1.28
TY2B-BQ12491 DSC2YOL073C 969 nt7.05□□□□□ -1.28
TY2B-BQ12491 RGT1YKL038W 3513 nt7.05□□□□□ -1.28
TY2B-BQ12491 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt7.05□□□□□ -1.28
TY2B-BQ12491 ARO80YDR421W 2853 nt7.04□□□□□ -1.28
TY2B-BQ12491 GSY1YFR015C 2127 nt7.04□□□□□ -1.28
TY2B-BQ12491 MAS1YLR163C 1389 nt7.04□□□□□ -1.28
TY2B-BQ12491 TRX2YGR209C 315 nt7.04□□□□□ -1.28
TY2B-BQ12491 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt7.04□□□□□ -1.28
TY2B-BQ12491 TOS2YGR221C 1869 nt7.03□□□□□ -1.28
TY2B-BQ12491 YOR379CYOR379C 339 nt7.03□□□□□ -1.28
TY2B-BQ12491 THS1YIL078W 2205 nt7.03□□□□□ -1.28
TY2B-BQ12491 PRO2YOR323C 1371 nt7.03□□□□□ -1.28
TY2B-BQ12491 TAF11YML015C 1041 nt7.03□□□□□ -1.28
TY2B-BQ12491 PDX3YBR035C 687 nt7.03□□□□□ -1.28
TY2B-BQ12491 KAR2YJL034W 2049 nt7.02□□□□□ -1.29
TY2B-BQ12491 PUT1YLR142W 1431 nt7.02□□□□□ -1.29
TY2B-BQ12491 RXT3YDL076C 885 nt7.02□□□□□ -1.29
TY2B-BQ12491 GTO1YGR154C 1071 nt7.02□□□□□ -1.29
TY2B-BQ12491 snR10snR10 245 nt7.02□□□□□ -1.29
TY2B-BQ12491 TRS33YOR115C 807 nt7.02□□□□□ -1.29
TY2B-BQ12491 TRP3YKL211C 1455 nt7.02□□□□□ -1.29
TY2B-BQ12491 ASA1YPR085C 1332 nt7.02□□□□□ -1.29
TY2B-BQ12491 YCR023CYCR023C 1836 nt7.01□□□□□ -1.29
TY2B-BQ12491 KGD1YIL125W 3045 nt7.01□□□□□ -1.29
TY2B-BQ12491 LOS1YKL205W 3303 nt7.01□□□□□ -1.29
TY2B-BQ12491 COA3YJL062W-A 258 nt7□□□□□ -1.29
TY2B-BQ12491 ARC1YGL105W 1131 nt7□□□□□ -1.29
TY2B-BQ12491 ARH1YDR376W 1482 nt6.99□□□□□ -1.29
TY2B-BQ12491 ALD6YPL061W 1503 nt6.99□□□□□ -1.29
TY2B-BQ12491 MTM1YGR257C 1101 nt6.99□□□□□ -1.29
TY2B-BQ12491 FAT3YKL187C 2253 nt6.98□□□□□ -1.29
TY2B-BQ12491 HST4YDR191W 1113 nt6.98□□□□□ -1.29
TY2B-BQ12491 MAL13YGR288W 1422 nt6.98□□□□□ -1.29
TY2B-BQ12491 PUS1YPL212C 1635 nt6.98□□□□□ -1.29
TY2B-BQ12491 HMS2YJR147W 1077 nt6.97□□□□□ -1.29
TY2B-BQ12491 IRC22YEL001C 678 nt6.97□□□□□ -1.29
TY2B-BQ12491 GMH1YKR030W 822 nt6.97□□□□□ -1.29
TY2B-BQ12491 YMD8YML038C 1329 nt6.97□□□□□ -1.29
TY2B-BQ12491 GCN20YFR009W 2259 nt6.96□□□□□ -1.29
TY2B-BQ12491 SPG4YMR107W 348 nt6.96□□□□□ -1.3
TY2B-BQ12491 TFG1YGR186W 2208 nt6.96□□□□□ -1.3
TY2B-BQ12491 SFT2YBL102W 648 nt6.95□□□□□ -1.3
TY2B-BQ12491 SFB3YHR098C 2790 nt6.95□□□□□ -1.3
TY2B-BQ12491 RCR2YDR003W 633 nt6.95□□□□□ -1.3
TY2B-BQ12491 KCC4YCL024W 3114 nt6.95□□□□□ -1.3
TY2B-BQ12491 UBX7YBR273C 1311 nt6.93□□□□□ -1.3
TY2B-BQ12491 CPR4YCR069W 957 nt6.93□□□□□ -1.3
TY2B-BQ12491 MPH2YDL247W 1830 nt6.93□□□□□ -1.3
TY2B-BQ12491 HPM1YIL110W 1134 nt6.92□□□□□ -1.3
TY2B-BQ12491 SUL2YLR092W 2682 nt6.92□□□□□ -1.3
TY2B-BQ12491 SOL1YNR034W 966 nt6.92□□□□□ -1.3
TY2B-BQ12491 HEL1YKR017C 1656 nt6.92□□□□□ -1.3
TY2B-BQ12491 APM2YHL019C 1818 nt6.92□□□□□ -1.3
TY2B-BQ12491 RPS4BYHR203C 786 nt6.91□□□□□ -1.3
TY2B-BQ12491 RPS4AYJR145C 786 nt6.91□□□□□ -1.3
TY2B-BQ12491 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt6.91□□□□□ -1.3
TY2B-BQ12491 NTA1YJR062C 1374 nt6.91□□□□□ -1.3
TY2B-BQ12491 AIM21YIR003W 2040 nt6.91□□□□□ -1.3
TY2B-BQ12491 MCM2YBL023C 2607 nt6.9□□□□□ -1.3
TY2B-BQ12491 UTP11YKL099C 753 nt6.9□□□□□ -1.3
TY2B-BQ12491 SMC5YOL034W 3282 nt6.9□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 SNF8YPL002C 702 nt6.9□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 CPS1YJL172W 1731 nt6.89□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 ASN2YGR124W 1719 nt6.89□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 GSY2YLR258W 2118 nt6.88□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 CPR1YDR155C 489 nt6.88□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 CTR3YLR411W 726 nt6.88□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 AST1YBL069W 1290 nt6.88□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 YOR131CYOR131C 657 nt6.88□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 TRM11YOL124C 1302 nt6.88□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 BIT2YBR270C 1638 nt6.88□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 RPC53YDL150W 1269 nt6.87□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 YDL228CYDL228C 642 nt6.87□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 MRS3YJL133W 945 nt6.87□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 YKL223WYKL223W 333 nt6.87□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 MSC2YDR205W 2175 nt6.87□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 RSC2YLR357W 2670 nt6.87□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 EPS1YIL005W 2106 nt6.87□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 SSB2YNL209W 1842 nt6.87□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 SGV1YPR161C 1974 nt6.86□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 GLC3YEL011W 2115 nt6.86□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 MHF2YDL160C-A 243 nt6.86□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 PCT1YGR202C 1275 nt6.86□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 POR1YNL055C 852 nt6.86□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 TNA1YGR260W 1605 nt6.86□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 OXP1YKL215C 3861 nt6.86□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 YIL055CYIL055C 1884 nt6.86□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 IMD3YLR432W 1572 nt6.86□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 AKL1YBR059C 3327 nt6.85□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 SIA1YOR137C 1869 nt6.85□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 ELP2YGR200C 2367 nt6.85□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 QCR2YPR191W 1107 nt6.85□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 CNN1YFR046C 1086 nt6.84□□□□□ -1.31
TY2B-BQ12491 YBR284WYBR284W 2394 nt6.83□□□□□ -1.32
TY2B-BQ12491 NOG2YNR053C 1461 nt6.83□□□□□ -1.32
TY2B-BQ12491 ADY3YDL239C 2373 nt6.83□□□□□ -1.32
TY2B-BQ12491 RCK2YLR248W 1833 nt6.82□□□□□ -1.32
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