Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC63Q05C16 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC63Q05C16 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC63Q05C16 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms