Protein–RNA interactions for Protein: P59827

BPIFB4, BPI fold-containing family B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFB4P59827 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPIFB4P59827 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPIFB4P59827 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPIFB4P59827 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPIFB4P59827 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BPIFB4P59827 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BPIFB4P59827 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPIFB4P59827 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPIFB4P59827 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPIFB4P59827 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPIFB4P59827 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPIFB4P59827 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPIFB4P59827 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPIFB4P59827 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPIFB4P59827 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPIFB4P59827 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPIFB4P59827 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BPIFB4P59827 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIFB4P59827 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIFB4P59827 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIFB4P59827 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIFB4P59827 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIFB4P59827 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIFB4P59827 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIFB4P59827 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIFB4P59827 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BPIFB4P59827 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BPIFB4P59827 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BPIFB4P59827 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BPIFB4P59827 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BPIFB4P59827 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BPIFB4P59827 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BPIFB4P59827 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BPIFB4P59827 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIFB4P59827 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIFB4P59827 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIFB4P59827 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIFB4P59827 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIFB4P59827 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIFB4P59827 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIFB4P59827 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIFB4P59827 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIFB4P59827 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BPIFB4P59827 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BPIFB4P59827 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIFB4P59827 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIFB4P59827 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIFB4P59827 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIFB4P59827 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIFB4P59827 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIFB4P59827 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIFB4P59827 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BPIFB4P59827 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms