Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC24CP53992 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms