Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2A2P52657 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
GTF2A2P52657 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms