Protein–RNA interactions for Protein: P40489

XBP1, Transcriptional repressor XBP1, yeastyeast

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Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
XBP1P40489 VMS1YDR049W 1899 nt4.93□□□□□ -1.62
XBP1P40489 RTT103YDR289C 1230 nt4.93□□□□□ -1.62
XBP1P40489 YGR176WYGR176W 348 nt4.93□□□□□ -1.62
XBP1P40489 ARD1YHR013C 717 nt4.93□□□□□ -1.62
XBP1P40489 GAT4YIR013C 366 nt4.93□□□□□ -1.62
XBP1P40489 APS3YJL024C 585 nt4.93□□□□□ -1.62
XBP1P40489 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt4.93□□□□□ -1.62
XBP1P40489 YAL064WYAL064W 285 nt4.93□□□□□ -1.62
XBP1P40489 URA4YLR420W 1095 nt4.93□□□□□ -1.62
XBP1P40489 YMR027WYMR027W 1413 nt4.93□□□□□ -1.62
XBP1P40489 YIF1YNL263C 945 nt4.93□□□□□ -1.62
XBP1P40489 YOL035CYOL035C 303 nt4.93□□□□□ -1.62
XBP1P40489 RPN8YOR261C 1017 nt4.93□□□□□ -1.62
XBP1P40489 HSP26YBR072W 645 nt4.93□□□□□ -1.62
XBP1P40489 PYC1YGL062W 3537 nt4.93□□□□□ -1.62
XBP1P40489 SCT1YBL011W 2280 nt4.93□□□□□ -1.62
XBP1P40489 ORC5YNL261W 1440 nt4.92□□□□□ -1.62
XBP1P40489 ALT1YLR089C 1779 nt4.92□□□□□ -1.62
XBP1P40489 YER010CYER010C 705 nt4.92□□□□□ -1.62
XBP1P40489 EPS1YIL005W 2106 nt4.92□□□□□ -1.62
XBP1P40489 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt4.92□□□□□ -1.62
XBP1P40489 STM1YLR150W 822 nt4.92□□□□□ -1.62
XBP1P40489 SPO20YMR017W 1194 nt4.92□□□□□ -1.62
XBP1P40489 CSM3YMR048W 954 nt4.92□□□□□ -1.62
XBP1P40489 YNL134CYNL134C 1131 nt4.92□□□□□ -1.62
XBP1P40489 PIN2YOR104W 849 nt4.92□□□□□ -1.62
XBP1P40489 VNX1YNL321W 2727 nt4.92□□□□□ -1.62
XBP1P40489 CLP1YOR250C 1338 nt4.92□□□□□ -1.62
XBP1P40489 SFB3YHR098C 2790 nt4.92□□□□□ -1.62
XBP1P40489 AVO1YOL078W 3531 nt4.92□□□□□ -1.62
XBP1P40489 TEA1YOR337W 2280 nt4.92□□□□□ -1.62
XBP1P40489 ERG7YHR072W 2196 nt4.91□□□□□ -1.62
XBP1P40489 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt4.91□□□□□ -1.62
XBP1P40489 BUD26YDR241W 288 nt4.91□□□□□ -1.62
XBP1P40489 SKI8YGL213C 1194 nt4.91□□□□□ -1.62
XBP1P40489 TFA2YKR062W 987 nt4.91□□□□□ -1.62
XBP1P40489 GEP5YLR091W 882 nt4.91□□□□□ -1.62
XBP1P40489 YLR365WYLR365W 333 nt4.91□□□□□ -1.62
XBP1P40489 YMR178WYMR178W 825 nt4.91□□□□□ -1.62
XBP1P40489 ARL3YPL051W 597 nt4.91□□□□□ -1.62
XBP1P40489 SEC18YBR080C 2277 nt4.91□□□□□ -1.62
XBP1P40489 KAR5YMR065W 1515 nt4.91□□□□□ -1.62
XBP1P40489 ADE13YLR359W 1449 nt4.9□□□□□ -1.62
XBP1P40489 SSK1YLR006C 2139 nt4.9□□□□□ -1.62
XBP1P40489 SOG2YOR353C 2376 nt4.9□□□□□ -1.62
XBP1P40489 ACC1YNR016C 6702 nt4.9□□□□□ -1.62
XBP1P40489 KNH1YDL049C 807 nt4.9□□□□□ -1.63
XBP1P40489 SUT1YGL162W 900 nt4.9□□□□□ -1.63
XBP1P40489 YGL218WYGL218W 651 nt4.9□□□□□ -1.63
XBP1P40489 SFC1YJR095W 969 nt4.9□□□□□ -1.63
XBP1P40489 ELF1YKL160W 438 nt4.9□□□□□ -1.63
XBP1P40489 TFS1YLR178C 660 nt4.9□□□□□ -1.63
XBP1P40489 POR1YNL055C 852 nt4.9□□□□□ -1.63
XBP1P40489 UBA3YPR066W 900 nt4.9□□□□□ -1.63
XBP1P40489 MET16YPR167C 786 nt4.9□□□□□ -1.63
XBP1P40489 RRT2YBR246W 1164 nt4.9□□□□□ -1.63
XBP1P40489 BPL1YDL141W 2073 nt4.9□□□□□ -1.63
XBP1P40489 SIT1YEL065W 1887 nt4.9□□□□□ -1.63
XBP1P40489 RIM101YHL027W 1878 nt4.9□□□□□ -1.63
XBP1P40489 SMF2YHR050W 1650 nt4.89□□□□□ -1.63
XBP1P40489 OCA4YCR095C 1089 nt4.89□□□□□ -1.63
XBP1P40489 RMD1YDL001W 1293 nt4.89□□□□□ -1.63
XBP1P40489 YDR541CYDR541C 1035 nt4.89□□□□□ -1.63
XBP1P40489 NCS6YGL211W 1080 nt4.89□□□□□ -1.63
XBP1P40489 YGR182CYGR182C 354 nt4.89□□□□□ -1.63
XBP1P40489 HSX1tR(CCU)J 72 nt4.89□□□□□ -1.63
XBP1P40489 LDB18YLL049W 540 nt4.89□□□□□ -1.63
XBP1P40489 GSY2YLR258W 2118 nt4.89□□□□□ -1.63
XBP1P40489 YML094C-AYML094C-A 402 nt4.89□□□□□ -1.63
XBP1P40489 ERI1YPL096C-A 207 nt4.89□□□□□ -1.63
XBP1P40489 CKS1YBR135W 453 nt4.89□□□□□ -1.63
XBP1P40489 PTM1YKL039W 1572 nt4.89□□□□□ -1.63
XBP1P40489 GYP1YOR070C 1914 nt4.89□□□□□ -1.63
XBP1P40489 RTT106YNL206C 1368 nt4.89□□□□□ -1.63
XBP1P40489 QDR3YBR043C 2070 nt4.88□□□□□ -1.63
XBP1P40489 YAP1801YHR161C 1914 nt4.88□□□□□ -1.63
XBP1P40489 HMLALPHA1YCL066W 528 nt4.88□□□□□ -1.63
XBP1P40489 MATALPHA1YCR040W 528 nt4.88□□□□□ -1.63
XBP1P40489 YDR029WYDR029W 315 nt4.88□□□□□ -1.63
XBP1P40489 MRPL13YKR006C 795 nt4.88□□□□□ -1.63
XBP1P40489 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt4.88□□□□□ -1.63
XBP1P40489 RHO2YNL090W 579 nt4.88□□□□□ -1.63
XBP1P40489 PSH1YOL054W 1221 nt4.88□□□□□ -1.63
XBP1P40489 YOR062CYOR062C 807 nt4.88□□□□□ -1.63
XBP1P40489 YPL068CYPL068C 882 nt4.88□□□□□ -1.63
XBP1P40489 IDI1YPL117C 867 nt4.88□□□□□ -1.63
XBP1P40489 PEX32YBR168W 1242 nt4.88□□□□□ -1.63
XBP1P40489 RRI1YDL216C 1323 nt4.88□□□□□ -1.63
XBP1P40489 TIM54YJL054W 1437 nt4.88□□□□□ -1.63
XBP1P40489 SNZ3YFL059W 897 nt4.87□□□□□ -1.63
XBP1P40489 YKL151CYKL151C 1014 nt4.87□□□□□ -1.63
XBP1P40489 ERG3YLR056W 1098 nt4.87□□□□□ -1.63
XBP1P40489 SEC13YLR208W 894 nt4.87□□□□□ -1.63
XBP1P40489 SNZ2YNL333W 897 nt4.87□□□□□ -1.63
XBP1P40489 RBD2YPL246C 789 nt4.87□□□□□ -1.63
XBP1P40489 VPS70YJR126C 2436 nt4.87□□□□□ -1.63
XBP1P40489 YML082WYML082W 1950 nt4.87□□□□□ -1.63
XBP1P40489 PEX19YDL065C 1029 nt4.86□□□□□ -1.63
XBP1P40489 HEM3YDL205C 984 nt4.86□□□□□ -1.63
XBP1P40489 COX26YDR119W-A 201 nt4.86□□□□□ -1.63
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