Protein–RNA interactions for Protein: P34228

SEF1, Putative transcription factor SEF1, yeastyeast

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEF1P34228 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt5.07□□□□□ -1.6
SEF1P34228 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.07□□□□□ -1.6
SEF1P34228 YGR066CYGR066C 879 nt5.07□□□□□ -1.6
SEF1P34228 PAU17YLL025W 375 nt5.07□□□□□ -1.6
SEF1P34228 UIP3YAR027W 708 nt5.07□□□□□ -1.6
SEF1P34228 PEX12YMR026C 1200 nt5.07□□□□□ -1.6
SEF1P34228 YNL143CYNL143C 393 nt5.07□□□□□ -1.6
SEF1P34228 OCA5YHL029C 2040 nt5.07□□□□□ -1.6
SEF1P34228 YIL067CYIL067C 2037 nt5.07□□□□□ -1.6
SEF1P34228 MAL13YGR288W 1422 nt5.06□□□□□ -1.6
SEF1P34228 MHR1YDR296W 681 nt5.06□□□□□ -1.6
SEF1P34228 CAD1YDR423C 1230 nt5.06□□□□□ -1.6
SEF1P34228 SNZ3YFL059W 897 nt5.06□□□□□ -1.6
SEF1P34228 RPT6YGL048C 1218 nt5.06□□□□□ -1.6
SEF1P34228 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.06□□□□□ -1.6
SEF1P34228 GRE3YHR104W 984 nt5.06□□□□□ -1.6
SEF1P34228 SNZ2YNL333W 897 nt5.06□□□□□ -1.6
SEF1P34228 YPL073CYPL073C 486 nt5.06□□□□□ -1.6
SEF1P34228 snR34snR34 203 nt5.06□□□□□ -1.6
SEF1P34228 PCL8YPL219W 1479 nt5.06□□□□□ -1.6
SEF1P34228 MIF2YKL089W 1650 nt5.05□□□□□ -1.6
SEF1P34228 ARN2YHL047C 1863 nt5.05□□□□□ -1.6
SEF1P34228 EXO1YOR033C 2109 nt5.05□□□□□ -1.6
SEF1P34228 LSM6YDR378C 261 nt5.05□□□□□ -1.6
SEF1P34228 PRO3YER023W 861 nt5.05□□□□□ -1.6
SEF1P34228 GLE2YER107C 1098 nt5.05□□□□□ -1.6
SEF1P34228 DBP8YHR169W 1296 nt5.05□□□□□ -1.6
SEF1P34228 YHR214WYHR214W 612 nt5.05□□□□□ -1.6
SEF1P34228 YLR124WYLR124W 345 nt5.05□□□□□ -1.6
SEF1P34228 YAR066WYAR066W 612 nt5.05□□□□□ -1.6
SEF1P34228 PSH1YOL054W 1221 nt5.05□□□□□ -1.6
SEF1P34228 MRL1YPR079W 1146 nt5.05□□□□□ -1.6
SEF1P34228 snR3snR3 194 nt5.05□□□□□ -1.6
SEF1P34228 YEH1YLL012W 1722 nt5.05□□□□□ -1.6
SEF1P34228 FKH1YIL131C 1455 nt5.05□□□□□ -1.6
SEF1P34228 SIP5YMR140W 1470 nt5.05□□□□□ -1.6
SEF1P34228 NDC1YML031W 1968 nt5.04□□□□□ -1.6
SEF1P34228 PIF1YML061C 2580 nt5.04□□□□□ -1.6
SEF1P34228 SLO1YER180C-A 258 nt5.04□□□□□ -1.6
SEF1P34228 ERV14YGL054C 417 nt5.04□□□□□ -1.6
SEF1P34228 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.04□□□□□ -1.6
SEF1P34228 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.04□□□□□ -1.6
SEF1P34228 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.04□□□□□ -1.6
SEF1P34228 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.04□□□□□ -1.6
SEF1P34228 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.04□□□□□ -1.6
SEF1P34228 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.04□□□□□ -1.6
SEF1P34228 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.04□□□□□ -1.6
SEF1P34228 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.04□□□□□ -1.6
SEF1P34228 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.04□□□□□ -1.6
SEF1P34228 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.04□□□□□ -1.6
SEF1P34228 YOR318CYOR318C 306 nt5.04□□□□□ -1.6
SEF1P34228 IBA57YJR122W 1494 nt5.04□□□□□ -1.6
SEF1P34228 SMF2YHR050W 1650 nt5.04□□□□□ -1.6
SEF1P34228 BUL1YMR275C 2931 nt5.03□□□□□ -1.6
SEF1P34228 MCM4YPR019W 2802 nt5.03□□□□□ -1.6
SEF1P34228 TBF1YPL128C 1689 nt5.03□□□□□ -1.6
SEF1P34228 YDL183CYDL183C 963 nt5.03□□□□□ -1.6
SEF1P34228 PFA5YDR459C 1125 nt5.03□□□□□ -1.6
SEF1P34228 NVJ1YHR195W 966 nt5.03□□□□□ -1.6
SEF1P34228 TFS1YLR178C 660 nt5.03□□□□□ -1.6
SEF1P34228 GFD1YMR255W 567 nt5.03□□□□□ -1.6
SEF1P34228 MDY2YOL111C 639 nt5.03□□□□□ -1.6
SEF1P34228 SMA1YPL027W 738 nt5.03□□□□□ -1.6
SEF1P34228 ISA2YPR067W 558 nt5.03□□□□□ -1.6
SEF1P34228 ECM33YBR078W 1290 nt5.03□□□□□ -1.6
SEF1P34228 ATP1YBL099W 1638 nt5.03□□□□□ -1.6
SEF1P34228 OMS1YDR316W 1416 nt5.03□□□□□ -1.6
SEF1P34228 RET1YOR207C 3450 nt5.02□□□□□ -1.61
SEF1P34228 COX26YDR119W-A 201 nt5.02□□□□□ -1.61
SEF1P34228 COS9YKL219W 1224 nt5.02□□□□□ -1.61
SEF1P34228 MSA2YKR077W 1092 nt5.02□□□□□ -1.61
SEF1P34228 ATP14YLR295C 375 nt5.02□□□□□ -1.61
SEF1P34228 RPL3YOR063W 1164 nt5.02□□□□□ -1.61
SEF1P34228 OAZ1YPL052W 879 nt5.02□□□□□ -1.61
SEF1P34228 SAM4YPL273W 978 nt5.02□□□□□ -1.61
SEF1P34228 NRG2YBR066C 663 nt5.02□□□□□ -1.61
SEF1P34228 GUA1YMR217W 1578 nt5.02□□□□□ -1.61
SEF1P34228 IFM1YOL023W 2031 nt5.02□□□□□ -1.61
SEF1P34228 FPK1YNR047W 2682 nt5.01□□□□□ -1.61
SEF1P34228 QDR3YBR043C 2070 nt5.01□□□□□ -1.61
SEF1P34228 YDL034WYDL034W 345 nt5.01□□□□□ -1.61
SEF1P34228 YDR445CYDR445C 408 nt5.01□□□□□ -1.61
SEF1P34228 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.01□□□□□ -1.61
SEF1P34228 PIN2YOR104W 849 nt5.01□□□□□ -1.61
SEF1P34228 NTH2YBR001C 2343 nt5.01□□□□□ -1.61
SEF1P34228 STL1YDR536W 1710 nt5□□□□□ -1.61
SEF1P34228 GET3YDL100C 1065 nt5□□□□□ -1.61
SEF1P34228 EDC1YGL222C 528 nt5□□□□□ -1.61
SEF1P34228 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5□□□□□ -1.61
SEF1P34228 ADD66YKL206C 804 nt5□□□□□ -1.61
SEF1P34228 NTR2YKR022C 969 nt5□□□□□ -1.61
SEF1P34228 HCR1YLR192C 798 nt5□□□□□ -1.61
SEF1P34228 CSR1YLR380W 1227 nt5□□□□□ -1.61
SEF1P34228 YOL131WYOL131W 327 nt5□□□□□ -1.61
SEF1P34228 RMI1YPL024W 726 nt5□□□□□ -1.61
SEF1P34228 MMP1YLL061W 1752 nt5□□□□□ -1.61
SEF1P34228 VCX1YDL128W 1236 nt4.99□□□□□ -1.61
SEF1P34228 YHP1YDR451C 1062 nt4.99□□□□□ -1.61
SEF1P34228 CHO1YER026C 831 nt4.99□□□□□ -1.61
SEF1P34228 YMR114CYMR114C 1107 nt4.99□□□□□ -1.61
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