Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PLNP26678 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PLNP26678 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLNP26678 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLNP26678 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLNP26678 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLNP26678 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLNP26678 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLNP26678 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLNP26678 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLNP26678 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLNP26678 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLNP26678 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLNP26678 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLNP26678 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLNP26678 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLNP26678 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLNP26678 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLNP26678 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLNP26678 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLNP26678 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLNP26678 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLNP26678 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLNP26678 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLNP26678 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLNP26678 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLNP26678 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLNP26678 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLNP26678 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLNP26678 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PLNP26678 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLNP26678 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLNP26678 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLNP26678 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLNP26678 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLNP26678 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLNP26678 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLNP26678 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLNP26678 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLNP26678 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLNP26678 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLNP26678 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLNP26678 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLNP26678 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLNP26678 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLNP26678 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLNP26678 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLNP26678 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLNP26678 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLNP26678 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLNP26678 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLNP26678 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLNP26678 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLNP26678 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLNP26678 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLNP26678 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLNP26678 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLNP26678 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLNP26678 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLNP26678 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLNP26678 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLNP26678 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLNP26678 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLNP26678 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLNP26678 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLNP26678 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLNP26678 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLNP26678 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLNP26678 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PLNP26678 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLNP26678 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLNP26678 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLNP26678 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLNP26678 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLNP26678 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLNP26678 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLNP26678 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLNP26678 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLNP26678 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLNP26678 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLNP26678 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLNP26678 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLNP26678 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLNP26678 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLNP26678 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLNP26678 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLNP26678 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLNP26678 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLNP26678 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLNP26678 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLNP26678 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLNP26678 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PLNP26678 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLNP26678 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLNP26678 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLNP26678 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PLNP26678 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLNP26678 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLNP26678 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PLNP26678 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms