Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCP20941 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCP20941 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCP20941 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCP20941 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDCP20941 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDCP20941 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDCP20941 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDCP20941 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDCP20941 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDCP20941 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDCP20941 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDCP20941 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDCP20941 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PDCP20941 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDCP20941 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDCP20941 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDCP20941 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDCP20941 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDCP20941 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDCP20941 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDCP20941 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDCP20941 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDCP20941 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PDCP20941 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDCP20941 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDCP20941 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDCP20941 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDCP20941 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDCP20941 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDCP20941 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDCP20941 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDCP20941 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDCP20941 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDCP20941 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDCP20941 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDCP20941 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PDCP20941 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDCP20941 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDCP20941 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCP20941 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCP20941 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCP20941 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCP20941 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCP20941 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCP20941 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCP20941 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCP20941 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCP20941 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCP20941 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCP20941 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCP20941 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCP20941 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCP20941 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCP20941 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCP20941 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCP20941 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCP20941 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCP20941 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCP20941 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCP20941 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCP20941 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCP20941 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCP20941 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCP20941 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDCP20941 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDCP20941 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDCP20941 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDCP20941 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDCP20941 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDCP20941 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDCP20941 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDCP20941 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDCP20941 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDCP20941 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDCP20941 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDCP20941 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDCP20941 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDCP20941 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDCP20941 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDCP20941 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDCP20941 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDCP20941 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PDCP20941 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PDCP20941 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDCP20941 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDCP20941 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDCP20941 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PDCP20941 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDCP20941 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDCP20941 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDCP20941 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDCP20941 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDCP20941 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDCP20941 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDCP20941 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDCP20941 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDCP20941 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDCP20941 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDCP20941 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms