Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
N4BP1O75113 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
N4BP1O75113 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4BP1O75113 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms