Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPR55Q9Y2T6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPR55Q9Y2T6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms