Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 VID24YBR105C 1089 nt7.46□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 snR4snR4 186 nt7.46□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 UIP5YKR044W 1332 nt7.46□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 VPS30YPL120W 1674 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 SLC1YDL052C 912 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 LYS20YDL182W 1287 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 YDR455CYDR455C 309 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 CAF16YFL028C 870 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 RPS31YLR167W 459 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 YMR166CYMR166C 1107 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 YNL190WYNL190W 615 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 MPD1YOR288C 957 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 SNX3YOR357C 489 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 OXR1YPL196W 822 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 NRG2YBR066C 663 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 BNI5YNL166C 1347 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 TYR1YBR166C 1359 nt7.45□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 SET4YJL105W 1683 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 CRF1YDR223W 1404 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 YDL186WYDL186W 834 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 BRR6YGL247W 594 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 YJU3YKL094W 942 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 TEM1YML064C 738 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 ADD37YMR184W 597 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 TRI1YMR233W 681 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 IZH2YOL002C 954 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 SLG1YOR008C 1137 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 ORT1YOR130C 879 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 ANT1YPR128C 987 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 YOS9YDR057W 1629 nt7.44□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 FUM1YPL262W 1467 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 PRS2YER099C 957 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 YER181CYER181C 324 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 YER188WYER188W 720 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 NSG2YNL156C 900 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 PNO1YOR145C 825 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 MFM1YPL060W 1242 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 ERG9YHR190W 1335 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 MPE1YKL059C 1326 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 STP4YDL048C 1473 nt7.43□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 PMA2YPL036W 2844 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 MSC1YML128C 1542 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 POX1YGL205W 2247 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 INO2YDR123C 915 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 SCM4YGR049W 564 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 COX6YHR051W 447 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 SOL3YHR163W 750 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 CYC1YJR048W 330 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 MTD1YKR080W 963 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 ENT4YLL038C 744 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 COS1YNL336W 1146 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 RDL1YOR285W 420 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 PRM3YPL192C 402 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 ASR1YPR093C 867 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 MET30YIL046W 1923 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 COQ6YGR255C 1440 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 ADE13YLR359W 1449 nt7.42□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 CLN1YMR199W 1641 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 YDR366CYDR366C 399 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 OYE2YHR179W 1203 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 YJR071WYJR071W 369 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 BOS1YLR078C 735 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 YML131WYML131W 1098 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 snR11snR11 258 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 MRPL40YPL173W 894 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 MUM2YBR057C 1101 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 YCL002CYCL002C 792 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 MLF3YNL074C 1359 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 UME1YPL139C 1383 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 TRP3YKL211C 1455 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 CDC3YLR314C 1563 nt7.41□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 PET100YDR079W 336 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 NOP16YER002W 696 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 YER006C-AYER006C-A 318 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 SEH1YGL100W 1050 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 QRI5YLR204W 336 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 AIM45YPR004C 1035 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 PHO12YHR215W 1404 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 PHO11YAR071W 1404 nt7.4□□□□□ -1.22
TY1A-BRQ12217 YLR072WYLR072W 2082 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 SAC7YDR389W 1965 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 SLX5YDL013W 1860 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 NOC4YPR144C 1659 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 YMR027WYMR027W 1413 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 KRR1YCL059C 951 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 MGT1YDL200C 567 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 CTH1YDR151C 978 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 YGR122WYGR122W 1209 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 YGR126WYGR126W 693 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 RTA1YGR213C 954 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 YGR290WYGR290W 444 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 RPS14BYJL191W 417 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 SFC1YJR095W 969 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 PAU16YKL224C 372 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 NAT4YMR069W 858 nt7.39□□□□□ -1.23
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