Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SLFN5Q08AF3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SLFN5Q08AF3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SLFN5Q08AF3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLFN5Q08AF3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms