Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP3M2P53677 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
AP3M2P53677 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
AP3M2P53677 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms