Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRYBA4P53673 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CRYBA4P53673 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRYBA4P53673 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRYBA4P53673 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRYBA4P53673 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRYBA4P53673 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRYBA4P53673 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRYBA4P53673 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRYBA4P53673 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRYBA4P53673 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRYBA4P53673 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRYBA4P53673 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRYBA4P53673 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRYBA4P53673 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRYBA4P53673 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRYBA4P53673 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRYBA4P53673 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CRYBA4P53673 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRYBA4P53673 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRYBA4P53673 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRYBA4P53673 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRYBA4P53673 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRYBA4P53673 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms