Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDB2O43679 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDB2O43679 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDB2O43679 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDB2O43679 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDB2O43679 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDB2O43679 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDB2O43679 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDB2O43679 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LDB2O43679 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDB2O43679 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDB2O43679 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDB2O43679 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDB2O43679 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDB2O43679 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDB2O43679 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDB2O43679 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDB2O43679 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDB2O43679 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDB2O43679 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDB2O43679 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDB2O43679 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDB2O43679 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LDB2O43679 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDB2O43679 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LDB2O43679 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDB2O43679 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDB2O43679 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDB2O43679 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDB2O43679 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDB2O43679 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LDB2O43679 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDB2O43679 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDB2O43679 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDB2O43679 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDB2O43679 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LDB2O43679 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDB2O43679 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDB2O43679 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LDB2O43679 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDB2O43679 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDB2O43679 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LDB2O43679 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDB2O43679 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LDB2O43679 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDB2O43679 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDB2O43679 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDB2O43679 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDB2O43679 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDB2O43679 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDB2O43679 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDB2O43679 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDB2O43679 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LDB2O43679 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LDB2O43679 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDB2O43679 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDB2O43679 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDB2O43679 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDB2O43679 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDB2O43679 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LDB2O43679 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDB2O43679 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDB2O43679 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDB2O43679 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDB2O43679 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDB2O43679 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDB2O43679 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LDB2O43679 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDB2O43679 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDB2O43679 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDB2O43679 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDB2O43679 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDB2O43679 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDB2O43679 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDB2O43679 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LDB2O43679 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDB2O43679 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDB2O43679 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDB2O43679 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDB2O43679 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDB2O43679 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDB2O43679 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LDB2O43679 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDB2O43679 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDB2O43679 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDB2O43679 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDB2O43679 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDB2O43679 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDB2O43679 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LDB2O43679 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDB2O43679 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDB2O43679 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDB2O43679 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDB2O43679 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDB2O43679 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDB2O43679 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDB2O43679 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDB2O43679 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LDB2O43679 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LDB2O43679 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms