Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PGBD4Q96DM1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGBD4Q96DM1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGBD4Q96DM1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms