Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD53Q8N9V6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD53Q8N9V6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD53Q8N9V6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD53Q8N9V6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD53Q8N9V6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD53Q8N9V6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD53Q8N9V6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD53Q8N9V6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD53Q8N9V6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD53Q8N9V6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD53Q8N9V6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ANKRD53Q8N9V6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ANKRD53Q8N9V6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ANKRD53Q8N9V6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD53Q8N9V6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD53Q8N9V6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms