Protein–RNA interactions for Protein: Q12074

SPE3, Spermidine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3Q12074 QDR3YBR043C 2070 nt5.7□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 GUP2YPL189W 1830 nt5.7□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 YDL034WYDL034W 345 nt5.7□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 MPM1YJL066C 759 nt5.7□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 PFA3YNL326C 1011 nt5.7□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 QRI1YDL103C 1434 nt5.7□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 SUB2YDL084W 1341 nt5.7□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 MET7YOR241W 1647 nt5.7□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 DBP9YLR276C 1785 nt5.7□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 PTR2YKR093W 1806 nt5.69□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 HIR1YBL008W 2523 nt5.69□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt5.69□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 RPS15YOL040C 429 nt5.69□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.69□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 YOR318CYOR318C 306 nt5.69□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 GSY2YLR258W 2118 nt5.69□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 YLH47YPR125W 1365 nt5.68□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 PRP40YKL012W 1752 nt5.68□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 MTC1YJL123C 1437 nt5.68□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 HSF1YGL073W 2502 nt5.68□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 CWC21YDR482C 408 nt5.68□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 TEL2YGR099W 2067 nt5.68□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 NUP1YOR098C 3231 nt5.68□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 URA7YBL039C 1740 nt5.68□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 BUL1YMR275C 2931 nt5.68□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 NOB1YOR056C 1380 nt5.67□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 NDC1YML031W 1968 nt5.67□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 FAT3YKL187C 2253 nt5.67□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 SNT2YGL131C 4212 nt5.67□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 YDR396WYDR396W 501 nt5.67□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 ATP14YLR295C 375 nt5.67□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 YNL228WYNL228W 777 nt5.67□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 SAM4YPL273W 978 nt5.67□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 CCZ1YBR131W 2115 nt5.67□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 NSI1YDR026C 1713 nt5.67□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 STL1YDR536W 1710 nt5.67□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 TRK2YKR050W 2670 nt5.66□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 EAF5YEL018W 840 nt5.66□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 SCW4YGR279C 1161 nt5.66□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 KRE9YJL174W 831 nt5.66□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 APN1YKL114C 1104 nt5.66□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 COS9YKL219W 1224 nt5.66□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 NPT1YOR209C 1290 nt5.66□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 CBC2YPL178W 627 nt5.66□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 RBD2YPL246C 789 nt5.66□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 RIM101YHL027W 1878 nt5.66□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 GET3YDL100C 1065 nt5.65□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 SRG1SRG1 551 nt5.65□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 PGA3YML125C 939 nt5.65□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 YNL194CYNL194C 906 nt5.65□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 TEF1YPR080W 1377 nt5.65□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 TEF2YBR118W 1377 nt5.65□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.64□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.64□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.64□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.64□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.64□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.64□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.64□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.64□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.64□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.64□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 YLR296WYLR296W 327 nt5.64□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 BSC5YNR069C 1470 nt5.64□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 SIP2YGL208W 1248 nt5.63□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 COS6YGR295C 1146 nt5.63□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt5.63□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 ELC1YPL046C 300 nt5.63□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 MRP51YPL118W 1035 nt5.63□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 GYP1YOR070C 1914 nt5.63□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 AAP1YHR047C 2571 nt5.63□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 UGO1YDR470C 1509 nt5.63□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 SPC97YHR172W 2472 nt5.62□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 SPT3YDR392W 1014 nt5.62□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 YJL171CYJL171C 1191 nt5.62□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 SFC1YJR095W 969 nt5.62□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 YNR042WYNR042W 429 nt5.62□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 CWC27YPL064C 906 nt5.62□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 PPR1YLR014C 2715 nt5.62□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 ALT1YLR089C 1779 nt5.62□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 SKG1YKR100C 1068 nt5.61□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 MMP1YLL061W 1752 nt5.61□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 POR1YNL055C 852 nt5.61□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 TBF1YPL128C 1689 nt5.61□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 TAH18YPR048W 1872 nt5.61□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 BAP2YBR068C 1830 nt5.6□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 TRP3YKL211C 1455 nt5.6□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 CDS1YBR029C 1374 nt5.6□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 TOM20YGR082W 552 nt5.6□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 GEP5YLR091W 882 nt5.6□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 YMR010WYMR010W 1218 nt5.6□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 CPA1YOR303W 1236 nt5.6□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 SCP1YOR367W 603 nt5.6□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 ENT2YLR206W 1842 nt5.6□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 SHE10YGL228W 1734 nt5.6□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 UTP7YER082C 1665 nt5.59□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 SRV2YNL138W 1581 nt5.59□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 ERG7YHR072W 2196 nt5.59□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 YPR195CYPR195C 330 nt5.59□□□□□ -1.51
SPE3Q12074 UTP18YJL069C 1785 nt5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 64 ms