Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSFMP43897 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSFMP43897 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSFMP43897 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSFMP43897 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TSFMP43897 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSFMP43897 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSFMP43897 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSFMP43897 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSFMP43897 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSFMP43897 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSFMP43897 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSFMP43897 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSFMP43897 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSFMP43897 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSFMP43897 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSFMP43897 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSFMP43897 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSFMP43897 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSFMP43897 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSFMP43897 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSFMP43897 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSFMP43897 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSFMP43897 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSFMP43897 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSFMP43897 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSFMP43897 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSFMP43897 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSFMP43897 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSFMP43897 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSFMP43897 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSFMP43897 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSFMP43897 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TSFMP43897 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSFMP43897 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSFMP43897 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSFMP43897 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSFMP43897 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSFMP43897 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSFMP43897 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSFMP43897 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSFMP43897 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSFMP43897 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSFMP43897 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSFMP43897 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSFMP43897 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSFMP43897 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSFMP43897 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSFMP43897 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSFMP43897 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSFMP43897 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSFMP43897 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSFMP43897 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSFMP43897 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSFMP43897 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSFMP43897 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSFMP43897 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSFMP43897 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSFMP43897 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSFMP43897 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSFMP43897 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSFMP43897 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSFMP43897 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSFMP43897 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSFMP43897 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSFMP43897 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSFMP43897 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSFMP43897 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TSFMP43897 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSFMP43897 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSFMP43897 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSFMP43897 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSFMP43897 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSFMP43897 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSFMP43897 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSFMP43897 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSFMP43897 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSFMP43897 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSFMP43897 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TSFMP43897 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSFMP43897 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSFMP43897 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSFMP43897 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSFMP43897 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSFMP43897 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSFMP43897 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSFMP43897 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSFMP43897 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSFMP43897 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSFMP43897 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TSFMP43897 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSFMP43897 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSFMP43897 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSFMP43897 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSFMP43897 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSFMP43897 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSFMP43897 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSFMP43897 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSFMP43897 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSFMP43897 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms