Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 RRT2YBR246W 1164 nt5.58□□□□□ -1.52
SEC28P40509 PRT1YOR361C 2292 nt5.58□□□□□ -1.52
SEC28P40509 TAX4YJL083W 1815 nt5.58□□□□□ -1.52
SEC28P40509 RHO2YNL090W 579 nt5.57□□□□□ -1.52
SEC28P40509 snR32snR32 188 nt5.57□□□□□ -1.52
SEC28P40509 GAS3YMR215W 1575 nt5.57□□□□□ -1.52
SEC28P40509 SHM1YBR263W 1473 nt5.57□□□□□ -1.52
SEC28P40509 STL1YDR536W 1710 nt5.57□□□□□ -1.52
SEC28P40509 GIP1YBR045C 1920 nt5.56□□□□□ -1.52
SEC28P40509 BUL1YMR275C 2931 nt5.56□□□□□ -1.52
SEC28P40509 CLP1YOR250C 1338 nt5.56□□□□□ -1.52
SEC28P40509 RSM10YDR041W 612 nt5.56□□□□□ -1.52
SEC28P40509 PMA1YGL008C 2757 nt5.56□□□□□ -1.52
SEC28P40509 TRP3YKL211C 1455 nt5.56□□□□□ -1.52
SEC28P40509 ORC5YNL261W 1440 nt5.56□□□□□ -1.52
SEC28P40509 CLB4YLR210W 1383 nt5.55□□□□□ -1.52
SEC28P40509 HEM3YDL205C 984 nt5.55□□□□□ -1.52
SEC28P40509 YIL060WYIL060W 435 nt5.55□□□□□ -1.52
SEC28P40509 SEC13YLR208W 894 nt5.55□□□□□ -1.52
SEC28P40509 TAF11YML015C 1041 nt5.55□□□□□ -1.52
SEC28P40509 HOR7YMR251W-A 180 nt5.55□□□□□ -1.52
SEC28P40509 ACC1YNR016C 6702 nt5.55□□□□□ -1.52
SEC28P40509 TRK2YKR050W 2670 nt5.55□□□□□ -1.52
SEC28P40509 UTP18YJL069C 1785 nt5.55□□□□□ -1.52
SEC28P40509 DBF2YGR092W 1719 nt5.54□□□□□ -1.52
SEC28P40509 ACS2YLR153C 2052 nt5.54□□□□□ -1.52
SEC28P40509 MAL11YGR289C 1851 nt5.54□□□□□ -1.52
SEC28P40509 FRE7YOL152W 1863 nt5.54□□□□□ -1.52
SEC28P40509 LCB2YDR062W 1686 nt5.54□□□□□ -1.52
SEC28P40509 BAP2YBR068C 1830 nt5.54□□□□□ -1.52
SEC28P40509 PHO86YJL117W 936 nt5.54□□□□□ -1.52
SEC28P40509 CKA2YOR061W 1020 nt5.54□□□□□ -1.52
SEC28P40509 GPA2YER020W 1350 nt5.54□□□□□ -1.52
SEC28P40509 GCR2YNL199C 1605 nt5.53□□□□□ -1.52
SEC28P40509 HST4YDR191W 1113 nt5.53□□□□□ -1.52
SEC28P40509 PGA2YNL149C 390 nt5.53□□□□□ -1.52
SEC28P40509 HEM15YOR176W 1182 nt5.53□□□□□ -1.52
SEC28P40509 YPL102CYPL102C 303 nt5.53□□□□□ -1.52
SEC28P40509 PWP1YLR196W 1731 nt5.53□□□□□ -1.52
SEC28P40509 HXT5YHR096C 1779 nt5.52□□□□□ -1.53
SEC28P40509 YJR124CYJR124C 1347 nt5.52□□□□□ -1.53
SEC28P40509 SNO4YMR322C 714 nt5.52□□□□□ -1.53
SEC28P40509 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt5.52□□□□□ -1.53
SEC28P40509 HSP33YOR391C 714 nt5.52□□□□□ -1.53
SEC28P40509 HSP32YPL280W 714 nt5.52□□□□□ -1.53
SEC28P40509 RPT1YKL145W 1404 nt5.51□□□□□ -1.53
SEC28P40509 NTH2YBR001C 2343 nt5.51□□□□□ -1.53
SEC28P40509 MTQ2YDR140W 666 nt5.51□□□□□ -1.53
SEC28P40509 RRT7YLL030C 342 nt5.51□□□□□ -1.53
SEC28P40509 PGA3YML125C 939 nt5.51□□□□□ -1.53
SEC28P40509 PIN2YOR104W 849 nt5.51□□□□□ -1.53
SEC28P40509 NGL2YMR285C 1548 nt5.51□□□□□ -1.53
SEC28P40509 ATR1YML116W 1629 nt5.51□□□□□ -1.53
SEC28P40509 STE12YHR084W 2067 nt5.51□□□□□ -1.53
SEC28P40509 ARB1YER036C 1833 nt5.51□□□□□ -1.53
SEC28P40509 DBP9YLR276C 1785 nt5.5□□□□□ -1.53
SEC28P40509 MKK2YPL140C 1521 nt5.5□□□□□ -1.53
SEC28P40509 PIF1YML061C 2580 nt5.5□□□□□ -1.53
SEC28P40509 VTH1YIL173W 4650 nt5.5□□□□□ -1.53
SEC28P40509 VTH2YJL222W 4650 nt5.5□□□□□ -1.53
SEC28P40509 TNA1YGR260W 1605 nt5.5□□□□□ -1.53
SEC28P40509 YDR154CYDR154C 351 nt5.5□□□□□ -1.53
SEC28P40509 YPR195CYPR195C 330 nt5.5□□□□□ -1.53
SEC28P40509 DFG5YMR238W 1377 nt5.5□□□□□ -1.53
SEC28P40509 UTP7YER082C 1665 nt5.5□□□□□ -1.53
SEC28P40509 SEN34YAR008W 828 nt5.49□□□□□ -1.53
SEC28P40509 YPR098CYPR098C 486 nt5.49□□□□□ -1.53
SEC28P40509 CDC43YGL155W 1131 nt5.48□□□□□ -1.53
SEC28P40509 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.48□□□□□ -1.53
SEC28P40509 ATG1YGL180W 2694 nt5.48□□□□□ -1.53
SEC28P40509 MEC3YLR288C 1425 nt5.48□□□□□ -1.53
SEC28P40509 CLA4YNL298W 2529 nt5.47□□□□□ -1.53
SEC28P40509 YDL144CYDL144C 1071 nt5.47□□□□□ -1.53
SEC28P40509 CBP4YGR174C 513 nt5.47□□□□□ -1.53
SEC28P40509 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.47□□□□□ -1.53
SEC28P40509 YLR296WYLR296W 327 nt5.47□□□□□ -1.53
SEC28P40509 MAC1YMR021C 1254 nt5.47□□□□□ -1.53
SEC28P40509 POR1YNL055C 852 nt5.47□□□□□ -1.53
SEC28P40509 MRPL22YNL177C 930 nt5.47□□□□□ -1.53
SEC28P40509 PDH1YPR002W 1551 nt5.46□□□□□ -1.53
SEC28P40509 FAA4YMR246W 2085 nt5.46□□□□□ -1.53
SEC28P40509 SHE10YGL228W 1734 nt5.46□□□□□ -1.54
SEC28P40509 SLD2YKL108W 1362 nt5.46□□□□□ -1.54
SEC28P40509 EPS1YIL005W 2106 nt5.46□□□□□ -1.54
SEC28P40509 YKL031WYKL031W 414 nt5.46□□□□□ -1.54
SEC28P40509 YLL059CYLL059C 507 nt5.46□□□□□ -1.54
SEC28P40509 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt5.46□□□□□ -1.54
SEC28P40509 YNL095CYNL095C 1929 nt5.46□□□□□ -1.54
SEC28P40509 UBA1YKL210W 3075 nt5.46□□□□□ -1.54
SEC28P40509 HPF1YOL155C 2904 nt5.45□□□□□ -1.54
SEC28P40509 ASH1YKL185W 1767 nt5.45□□□□□ -1.54
SEC28P40509 YTA12YMR089C 2478 nt5.45□□□□□ -1.54
SEC28P40509 COX26YDR119W-A 201 nt5.45□□□□□ -1.54
SEC28P40509 YGR022CYGR022C 330 nt5.45□□□□□ -1.54
SEC28P40509 VMA16YHR026W 642 nt5.45□□□□□ -1.54
SEC28P40509 YKL223WYKL223W 333 nt5.45□□□□□ -1.54
SEC28P40509 TOM40YMR203W 1164 nt5.45□□□□□ -1.54
SEC28P40509 YNR048WYNR048W 1182 nt5.45□□□□□ -1.54
SEC28P40509 SEC12YNR026C 1416 nt5.45□□□□□ -1.54
SEC28P40509 MRE11YMR224C 2079 nt5.44□□□□□ -1.54
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