Protein–RNA interactions for Protein: A1L188

NDUFAF8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF8A1L188 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
NDUFAF8A1L188 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NDUFAF8A1L188 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
NDUFAF8A1L188 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NDUFAF8A1L188 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NDUFAF8A1L188 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
NDUFAF8A1L188 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NDUFAF8A1L188 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NDUFAF8A1L188 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NDUFAF8A1L188 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NDUFAF8A1L188 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NDUFAF8A1L188 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NDUFAF8A1L188 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
NDUFAF8A1L188 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
NDUFAF8A1L188 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms