Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FSCN3Q9NQT6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSCN3Q9NQT6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FSCN3Q9NQT6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms