Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS4Q9NQG7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS4Q9NQG7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS4Q9NQG7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms