Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ALS2CR12Q96Q35 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALS2CR12Q96Q35 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALS2CR12Q96Q35 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1025.1 ms