Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCBE1Q6UXH8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCBE1Q6UXH8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms