Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD1

TIMM23B, Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23BQ5SRD1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM23BQ5SRD1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TIMM23BQ5SRD1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM23BQ5SRD1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms