Protein–RNA interactions for Protein: Q12470

TY1A-NL2, Transposon Ty1-NL2 Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL2Q12470 CCS1YMR038C 750 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 YPR078CYPR078C 1119 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 GRX1YCL035C 333 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 ATF1YOR377W 1578 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 DAS2YDR020C 699 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 STE18YJR086W 333 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 TTI2YJR136C 1266 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 YLR257WYLR257W 966 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 YML003WYML003W 873 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 ATP19YOL077W-A 207 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 PET123YOR158W 957 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 YOR199WYOR199W 330 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 RIM2YBR192W 1134 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 ITR2YOL103W 1830 nt7.61□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 HIP1YGR191W 1812 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 CLB3YDL155W 1284 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 RML2YEL050C 1182 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 CWC23YGL128C 852 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 RRP46YGR095C 672 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 RPL27AYHR010W 411 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 RPC17YJL011C 486 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 MRT4YKL009W 711 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 PAU7YAR020C 168 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 PRM9YAR031W 897 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 YLR184WYLR184W 348 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 YNL120CYNL120C 486 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 PFA3YNL326C 1011 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 PRE6YOL038W 765 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 HST2YPL015C 1074 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 ATR1YML116W 1629 nt7.6□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 YMR265CYMR265C 1386 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 TAT2YOL020W 1779 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 SPS2YDR522C 1509 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 VCX1YDL128W 1236 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 UGX2YDL169C 672 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 RPL4BYDR012W 1089 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 YFL066CYFL066C 1179 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 LYS5YGL154C 819 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 MRP4YHL004W 1185 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 PEP8YJL053W 1140 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 YJL218WYJL218W 591 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 HOT13YKL084W 351 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 YML053CYML053C 639 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 AAD14YNL331C 1131 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 LEU4YNL104C 1860 nt7.59□□□□□ -1.19
TY1A-NL2Q12470 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 SNF11YDR073W 510 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 GRH1YDR517W 1119 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 BGL2YGR282C 942 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 AIM1YAL046C 357 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 YNL324WYNL324W 396 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 FMP23YBR047W 528 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 YPR130CYPR130C 408 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 MSF1YPR047W 1410 nt7.58□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 CUS1YMR240C 1311 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 TOS4YLR183C 1470 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 SAM2YDR502C 1155 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 LSM5YER146W 282 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 DDI2YFL061W 678 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 DDI3YNL335W 678 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 MVD1YNR043W 1191 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 YOR114WYOR114W 885 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 ICS2YBR157C 768 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 WSC4YHL028W 1818 nt7.57□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 RDS2YPL133C 1341 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 AKR2YOR034C 2250 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 YER156CYER156C 1017 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 FOL2YGR267C 732 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 LEU5YHR002W 1074 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 RPS10BYMR230W 318 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 UFE1YOR075W 1041 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 MUP3YHL036W 1641 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 YCK1YHR135C 1617 nt7.56□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 YEH1YLL012W 1722 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 GDA1YEL042W 1557 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 CSM1YCR086W 573 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 BUG1YDL099W 1026 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 RAD55YDR076W 1221 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 TAF10YDR167W 621 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 ECM11YDR446W 909 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 EDC2YER035W 438 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 RPL24BYGR148C 468 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 ARC15YIL062C 465 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 AUR1YKL004W 1206 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 YLR339CYLR339C 552 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 RAS2YNL098C 969 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 RPC31YNL151C 756 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 ATP23YNR020C 813 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 BSD2YBR290W 966 nt7.55□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 PMT3YOR321W 2262 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 RKM2YDR198C 1440 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 MTC1YJL123C 1437 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 SAG1YJR004C 1953 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 COS7YDL248W 1152 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 RPN14YGL004C 1254 nt7.54□□□□□ -1.2
TY1A-NL2Q12470 TDA10YGR205W 873 nt7.54□□□□□ -1.2
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