Protein–RNA interactions for Protein: Q12457

NSI1, RNA polymerase I termination factor, yeastyeast

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSI1Q12457 YML101C-AYML101C-A 318 nt6.39□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 TOM40YMR203W 1164 nt6.39□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 MED4YOR174W 855 nt6.39□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 RPL5YPL131W 894 nt6.39□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 MSC3YLR219W 2187 nt6.38□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 YJU2YKL095W 837 nt6.38□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 PSR2YLR019W 1194 nt6.38□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 MRPL19YNL185C 477 nt6.38□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 YPR076WYPR076W 375 nt6.38□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 RXT2YBR095C 1293 nt6.38□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 YMR034CYMR034C 1305 nt6.38□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 PEX31YGR004W 1389 nt6.38□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 COX15YER141W 1461 nt6.38□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 AIM17YHL021C 1398 nt6.37□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 VAC17YCL063W 1272 nt6.37□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 RRG1YDR065W 1098 nt6.37□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 AGX1YFL030W 1158 nt6.37□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 YMR245WYMR245W 621 nt6.37□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 YPL014WYPL014W 1146 nt6.37□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 DEF1YKL054C 2217 nt6.37□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 YMR027WYMR027W 1413 nt6.36□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 MTQ2YDR140W 666 nt6.36□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 HIM1YDR317W 1245 nt6.36□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 STE2YFL026W 1296 nt6.36□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 ERV14YGL054C 417 nt6.36□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt6.36□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 RPB4YJL140W 666 nt6.36□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 HOC1YJR075W 1191 nt6.36□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 URA5YML106W 681 nt6.36□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 YNL174WYNL174W 573 nt6.36□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 YOR097CYOR097C 528 nt6.36□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 RDL1YOR285W 420 nt6.36□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 GRX5YPL059W 453 nt6.36□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 YPL191CYPL191C 1083 nt6.36□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 ADH5YBR145W 1056 nt6.36□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 RRT2YBR246W 1164 nt6.36□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 VPS72YDR485C 2388 nt6.36□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 YHR020WYHR020W 2067 nt6.35□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 PPM2YOL141W 2088 nt6.35□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 RIO1YOR119C 1455 nt6.35□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 TED1YIL039W 1422 nt6.35□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 IRS4YKR019C 1848 nt6.35□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 HTB1YDR224C 396 nt6.35□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 TRS23YDR246W 660 nt6.35□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 CLC1YGR167W 702 nt6.35□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 AIM20YIL158W 615 nt6.35□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 MRPL49YJL096W 486 nt6.35□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 LIA1YJR070C 978 nt6.35□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 DID2YKR035W-A 615 nt6.35□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 YLR184WYLR184W 348 nt6.35□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 CPR6YLR216C 1116 nt6.35□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 ORM2YLR350W 651 nt6.35□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 MRPS17YMR188C 714 nt6.35□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 TOS6YNL300W 309 nt6.35□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 POC4YPL144W 447 nt6.35□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 APA1YCL050C 966 nt6.35□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 PMT3YOR321W 2262 nt6.35□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 LDB17YDL146W 1476 nt6.34□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 TEC1YBR083W 1461 nt6.34□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 AVO1YOL078W 3531 nt6.34□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 NUP49YGL172W 1419 nt6.34□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 YBR284WYBR284W 2394 nt6.34□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 GPD1YDL022W 1176 nt6.34□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 PPH21YDL134C 1110 nt6.34□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 OPI7YDR360W 435 nt6.34□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 POP6YGR030C 477 nt6.34□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 PAN5YHR063C 1140 nt6.34□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 ALB1YJL122W 528 nt6.34□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 ATG36YJL185C 882 nt6.34□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 YJR107WYJR107W 987 nt6.34□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 CCE1YKL011C 1062 nt6.34□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 YBL062WYBL062W 381 nt6.34□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 SNN1YNL086W 309 nt6.34□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 CKB2YOR039W 777 nt6.34□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 DCI1YOR180C 816 nt6.34□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 YPR027CYPR027C 834 nt6.34□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 PMT2YAL023C 2280 nt6.34□□□□□ -1.39
NSI1Q12457 HXT15YDL245C 1704 nt6.33□□□□□ -1.4
NSI1Q12457 HXT16YJR158W 1704 nt6.33□□□□□ -1.4
NSI1Q12457 RAP1YNL216W 2484 nt6.33□□□□□ -1.4
NSI1Q12457 GPM2YDL021W 936 nt6.33□□□□□ -1.4
NSI1Q12457 YDR042CYDR042C 603 nt6.33□□□□□ -1.4
NSI1Q12457 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.33□□□□□ -1.4
NSI1Q12457 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.33□□□□□ -1.4
NSI1Q12457 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.33□□□□□ -1.4
NSI1Q12457 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.33□□□□□ -1.4
NSI1Q12457 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.33□□□□□ -1.4
NSI1Q12457 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.33□□□□□ -1.4
NSI1Q12457 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.33□□□□□ -1.4
NSI1Q12457 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.33□□□□□ -1.4
NSI1Q12457 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.33□□□□□ -1.4
NSI1Q12457 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.33□□□□□ -1.4
NSI1Q12457 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.33□□□□□ -1.4
NSI1Q12457 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.33□□□□□ -1.4
NSI1Q12457 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.33□□□□□ -1.4
NSI1Q12457 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.33□□□□□ -1.4
NSI1Q12457 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.33□□□□□ -1.4
NSI1Q12457 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.33□□□□□ -1.4
NSI1Q12457 RSM26YJR101W 801 nt6.33□□□□□ -1.4
NSI1Q12457 GCN3YKR026C 918 nt6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 96.7 ms