Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	PWP1	YLR196W	1731 nt		5.43	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	ATO3	YDR384C	828 nt		5.42	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	CDC43	YGL155W	1131 nt		5.42	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	EXO1	YOR033C	2109 nt		5.41	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	RML2	YEL050C	1182 nt		5.41	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	YHL018W	YHL018W	363 nt		5.41	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	RMA1	YKL132C	1293 nt		5.41	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	AMD1	YML035C	2433 nt		5.4	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	NGL2	YMR285C	1548 nt		5.4	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	DBP8	YHR169W	1296 nt		5.4	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	YKR073C	YKR073C	321 nt		5.4	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	HCR1	YLR192C	798 nt		5.4	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	UBC11	YOR339C	471 nt		5.4	□□□□□ -1.54
VIK1	Q12045	PRI2	YKL045W	1587 nt		5.4	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	MCX1	YBR227C	1563 nt		5.4	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	BIT2	YBR270C	1638 nt		5.4	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	VHS1	YDR247W	1386 nt		5.4	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	PDI1	YCL043C	1569 nt		5.39	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	PDE1	YGL248W	1110 nt		5.39	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	DSF1	YEL070W	1509 nt		5.38	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	YNR073C	YNR073C	1509 nt		5.38	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	FOL1	YNL256W	2475 nt		5.38	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	GLE1	YDL207W	1617 nt		5.38	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	HXT3	YDR345C	1704 nt		5.38	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	DRE2	YKR071C	1047 nt		5.38	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	YBR144C	YBR144C	315 nt		5.38	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	MRPS5	YBR251W	924 nt		5.38	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	SMF3	YLR034C	1422 nt		5.38	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	SYG1	YIL047C	2709 nt		5.38	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	RRP9	YPR137W	1722 nt		5.37	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	UTP18	YJL069C	1785 nt		5.37	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	MTW1	YAL034W-A	870 nt		5.37	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	QRI5	YLR204W	336 nt		5.37	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	PPG1	YNR032W	1107 nt		5.37	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	NTH2	YBR001C	2343 nt		5.37	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	HFI1	YPL254W	1467 nt		5.37	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	BAP2	YBR068C	1830 nt		5.37	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	PMT2	YAL023C	2280 nt		5.36	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	APS3	YJL024C	585 nt		5.36	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	YML101C-A	YML101C-A	318 nt		5.36	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	DOM34	YNL001W	1161 nt		5.36	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	YOR111W	YOR111W	699 nt		5.36	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	ECM33	YBR078W	1290 nt		5.36	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	STL1	YDR536W	1710 nt		5.36	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	ELP3	YPL086C	1674 nt		5.35	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	SNT2	YGL131C	4212 nt		5.35	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	GCV3	YAL044C	513 nt		5.35	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	YKL107W	YKL107W	930 nt		5.35	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	PUS5	YLR165C	765 nt		5.35	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	RPS15	YOL040C	429 nt		5.35	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	YPR160C-A	YPR160C-A	285 nt		5.35	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	CYK3	YDL117W	2658 nt		5.35	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	SPC97	YHR172W	2472 nt		5.35	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	APM2	YHL019C	1818 nt		5.34	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	TUL1	YKL034W	2277 nt		5.34	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	OPI7	YDR360W	435 nt		5.34	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	YBL044W	YBL044W	369 nt		5.34	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	YNL019C	YNL019C	855 nt		5.34	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	YNL033W	YNL033W	855 nt		5.34	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	RPS9A	YPL081W	594 nt		5.34	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	DAL81	YIR023W	2913 nt		5.34	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	YNL095C	YNL095C	1929 nt		5.34	□□□□□ -1.55
VIK1	Q12045	SLT2	YHR030C	1455 nt		5.33	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	ADE12	YNL220W	1302 nt		5.33	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	MDH1	YKL085W	1005 nt		5.33	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	YNL165W	YNL165W	1221 nt		5.33	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	ARN2	YHL047C	1863 nt		5.32	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	VMA13	YPR036W	1437 nt		5.32	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	DOT5	YIL010W	648 nt		5.32	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	CSG2	YBR036C	1233 nt		5.32	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	SKS1	YPL026C	1509 nt		5.32	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	YJR085C	YJR085C	318 nt		5.31	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	CDC4	YFL009W	2340 nt		5.31	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	DAK1	YML070W	1755 nt		5.31	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	NGR1	YBR212W	2019 nt		5.31	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	BUL1	YMR275C	2931 nt		5.3	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	YDL114W	YDL114W	927 nt		5.3	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	GCS1	YDL226C	1059 nt		5.3	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	RPT6	YGL048C	1218 nt		5.3	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	YGL185C	YGL185C	1140 nt		5.3	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	RNH201	YNL072W	924 nt		5.3	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	DCI1	YOR180C	816 nt		5.3	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	RAT1	YOR048C	3021 nt		5.3	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	NUD1	YOR373W	2556 nt		5.3	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	BRF1	YGR246C	1791 nt		5.29	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	ARO10	YDR380W	1908 nt		5.29	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	YER187W	YER187W	426 nt		5.29	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	MTQ1	YNL063W	945 nt		5.29	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	PEX32	YBR168W	1242 nt		5.29	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	KCH1	YJR054W	1494 nt		5.28	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	YEA6	YEL006W	1008 nt		5.28	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	YML018C	YML018C	1182 nt		5.28	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	CKA2	YOR061W	1020 nt		5.28	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	SED4	YCR067C	3198 nt		5.28	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	PRP46	YPL151C	1356 nt		5.28	□□□□□ -1.56
VIK1	Q12045	PIF1	YML061C	2580 nt		5.27	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	MKC7	YDR144C	1791 nt		5.27	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	FHN1	YGR131W	525 nt		5.27	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	WTM2	YOR229W	1404 nt		5.27	□□□□□ -1.57
VIK1	Q12045	UBP9	YER098W	2265 nt		5.27	□□□□□ -1.57

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