Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 YFH7YFR007W 1062 nt6.67□□□□□ -1.34 RIP-Chip
PUF3Q07807 ERG25YGR060W 930 nt6.67□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 CBT1YKL208W 816 nt6.67□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 YAL066WYAL066W 309 nt6.67□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 GTO3YMR251W 1101 nt6.67□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 RAS1YOR101W 930 nt6.67□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 YBR027CYBR027C 333 nt6.67□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 RRP36YOR287C 903 nt6.67□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 LOA1YPR139C 903 nt6.67□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 RXT2YBR095C 1293 nt6.67□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 CLN1YMR199W 1641 nt6.67□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 NTE1YML059C 5040 nt6.67□□□□□ -1.34 RIP-Chip
PUF3Q07807 PHO3YBR092C 1404 nt6.67□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 YDR132CYDR132C 1488 nt6.66□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 ZWF1YNL241C 1518 nt6.66□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 EMP65YER140W 1671 nt6.66□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 AIM20YIL158W 615 nt6.66□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 QCR8YJL166W 285 nt6.66□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 SFT2YBL102W 648 nt6.66□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 SET6YPL165C 1122 nt6.66□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 DAP1YPL170W 459 nt6.66□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 CRP1YHR146W 1398 nt6.66□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 ENP1YBR247C 1452 nt6.66□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 YCR100CYCR100C 951 nt6.65□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 MTQ2YDR140W 666 nt6.65□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 YNL174WYNL174W 573 nt6.65□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 POC4YPL144W 447 nt6.65□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 ARG81YML099C 2643 nt6.65□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 YDR042CYDR042C 603 nt6.64□□□□□ -1.35 RIP-Chip
PUF3Q07807 KXD1YGL079W 657 nt6.64□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 LCB3YJL134W 1230 nt6.64□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 YJR084WYJR084W 1272 nt6.64□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 URA5YML106W 681 nt6.64□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 RFA2YNL312W 822 nt6.64□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 KTR1YOR099W 1182 nt6.64□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 ATG32YIL146C 1590 nt6.64□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 MRPL25YGR076C 474 nt6.63□□□□□ -1.35 RIP-Chip
PUF3Q07807 DMA1YHR115C 1251 nt6.63□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 SPO16YHR153C 597 nt6.63□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 GCV3YAL044C 513 nt6.63□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 YKR051WYKR051W 1257 nt6.63□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 CHS5YLR330W 2016 nt6.63□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 YMR279CYMR279C 1623 nt6.63□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 NCE103YNL036W 666 nt6.63□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 YNR025CYNR025C 360 nt6.63□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 snR37snR37 386 nt6.63□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 SPS22YCL048W 1392 nt6.63□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 HRQ1YDR291W 3234 nt6.63□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 APM3YBR288C 1452 nt6.62□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 PEX19YDL065C 1029 nt6.62□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 YDR401WYDR401W 564 nt6.62□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 FPR2YDR519W 408 nt6.62□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 HMS2YJR147W 1077 nt6.62□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 YLR402WYLR402W 192 nt6.62□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 SRT1YMR101C 1032 nt6.62□□□□□ -1.35 RIP-Chip
PUF3Q07807 MDM12YOL009C 816 nt6.62□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 YOL150CYOL150C 312 nt6.62□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 GLN3YER040W 2193 nt6.62□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 RIX7YLL034C 2514 nt6.61□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 ECM30YLR436C 3825 nt6.61□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 VPS61YDR136C 573 nt6.61□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 YKL153WYKL153W 510 nt6.61□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 HST2YPL015C 1074 nt6.61□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 ECM8YBR076W 1065 nt6.61□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 KCH1YJR054W 1494 nt6.6□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 YJL032WYJL032W 315 nt6.6□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 MRPL49YJL096W 486 nt6.6□□□□□ -1.35 RIP-Chip
PUF3Q07807 DRE2YKR071C 1047 nt6.6□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 PEX13YLR191W 1161 nt6.6□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt6.6□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 FPR3YML074C 1236 nt6.6□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 RUF20RUF20 443 nt6.6□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 BSC4YNL269W 396 nt6.6□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 SCS22YBL091C-A 528 nt6.6□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 FRE5YOR384W 2085 nt6.6□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 TFC6YDR362C 2019 nt6.6□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 YEF1YEL041W 1488 nt6.6□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 UBP8YMR223W 1416 nt6.59□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 PGM1YKL127W 1713 nt6.59□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 SCL1YGL011C 759 nt6.59□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 CUP2YGL166W 678 nt6.59□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 ICS3YJL077C 396 nt6.59□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 ELF1YKL160W 438 nt6.59□□□□□ -1.35 RIP-Chip
PUF3Q07807 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt6.59□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 ORM2YLR350W 651 nt6.59□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 COX11YPL132W 903 nt6.59□□□□□ -1.35 RIP-Chip
PUF3Q07807 HAL1YPR005C 885 nt6.59□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 TAE1YBR261C 699 nt6.59□□□□□ -1.35
PUF3Q07807 YLR108CYLR108C 1458 nt6.59□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 MMR1YLR190W 1476 nt6.59□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 YDR187CYDR187C 519 nt6.58□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt6.58□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt6.58□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 SPO20YMR017W 1194 nt6.58□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 YBL070CYBL070C 321 nt6.58□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 FYV6YNL133C 522 nt6.58□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 YBL112CYBL112C 318 nt6.58□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 YMC1YPR058W 924 nt6.58□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 DHH1YDL160C 1521 nt6.58□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 MEK1YOR351C 1494 nt6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38 ms