Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 URA3YEL021W 804 nt5.55□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.55□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 GCV3YAL044C 513 nt5.55□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 RHO2YNL090W 579 nt5.55□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 RPS3YNL178W 723 nt5.55□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 CKA2YOR061W 1020 nt5.55□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 CAM1YPL048W 1248 nt5.55□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 TUL1YKL034W 2277 nt5.55□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 CDC1YDR182W 1476 nt5.54□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 YGR291CYGR291C 222 nt5.54□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.54□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.54□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.54□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.54□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.54□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 RHO3YIL118W 696 nt5.54□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 ASK1YKL052C 879 nt5.54□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 YJU3YKL094W 942 nt5.54□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 MAC1YMR021C 1254 nt5.54□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 YHM2YMR241W 945 nt5.54□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 SUE1YPR151C 621 nt5.54□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt5.54□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 RPT1YKL145W 1404 nt5.54□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 NRD1YNL251C 1728 nt5.54□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 ZWF1YNL241C 1518 nt5.53□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 YPK2YMR104C 2034 nt5.53□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 HSF1YGL073W 2502 nt5.53□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 HPF1YOL155C 2904 nt5.53□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt5.53□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 RME1YGR044C 903 nt5.53□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 YLR317WYLR317W 435 nt5.53□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 YLR463CYLR463C 552 nt5.53□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 PDR16YNL231C 1056 nt5.53□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 COX11YPL132W 903 nt5.53□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 OSW2YLR054C 2175 nt5.53□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 VRP1YLR337C 2454 nt5.53□□□□□ -1.52
CIK1Q01649 STE12YHR084W 2067 nt5.52□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 GCR2YNL199C 1605 nt5.52□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 CRF1YDR223W 1404 nt5.52□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 YDR187CYDR187C 519 nt5.52□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 TFG2YGR005C 1203 nt5.52□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 YKR045CYKR045C 552 nt5.52□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 YLR122CYLR122C 378 nt5.52□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 FPR3YML074C 1236 nt5.52□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 MDY2YOL111C 639 nt5.52□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 QDR3YBR043C 2070 nt5.52□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 ATR1YML116W 1629 nt5.52□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 DBF2YGR092W 1719 nt5.51□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 GPD2YOL059W 1323 nt5.51□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 PTC3YBL056W 1407 nt5.51□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 YER186CYER186C 921 nt5.51□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 RPS2YGL123W 765 nt5.51□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 CUP2YGL166W 678 nt5.51□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 PML1YLR016C 615 nt5.51□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 YML018CYML018C 1182 nt5.51□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 YMR122CYMR122C 375 nt5.51□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 HOR7YMR251W-A 180 nt5.51□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 RPC19YNL113W 429 nt5.51□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 YNR048WYNR048W 1182 nt5.51□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 SLD2YKL108W 1362 nt5.51□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 DFG5YMR238W 1377 nt5.51□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 RRP9YPR137W 1722 nt5.51□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 YGR139WYGR139W 339 nt5.5□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 SPG4YMR107W 348 nt5.5□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.5□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 MMR1YLR190W 1476 nt5.5□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 UIP5YKR044W 1332 nt5.49□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 MRE11YMR224C 2079 nt5.49□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 DPH2YKL191W 1605 nt5.49□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 RAM1YDL090C 1296 nt5.49□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 HEM3YDL205C 984 nt5.49□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 RSA3YLR221C 663 nt5.49□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.49□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 TSA1YML028W 591 nt5.49□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 OSW5YMR148W 447 nt5.49□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 TOM40YMR203W 1164 nt5.49□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 OCA1YNL099C 717 nt5.49□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 EXO1YOR033C 2109 nt5.49□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 TAE1YBR261C 699 nt5.49□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 MCX1YBR227C 1563 nt5.48□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 YDL121CYDL121C 450 nt5.48□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 YJR084WYJR084W 1272 nt5.48□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 PSH1YOL054W 1221 nt5.48□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 PMA1YGL008C 2757 nt5.48□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 HXT5YHR096C 1779 nt5.47□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 MSP1YGR028W 1089 nt5.47□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 TDH2YJR009C 999 nt5.47□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 YKL031WYKL031W 414 nt5.47□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 QRI5YLR204W 336 nt5.47□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.47□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 ACS2YLR153C 2052 nt5.47□□□□□ -1.53
CIK1Q01649 PWP1YLR196W 1731 nt5.46□□□□□ -1.54
CIK1Q01649 DBP8YHR169W 1296 nt5.46□□□□□ -1.54
CIK1Q01649 SFC1YJR095W 969 nt5.46□□□□□ -1.54
CIK1Q01649 RRS1YOR294W 612 nt5.46□□□□□ -1.54
CIK1Q01649 MEC3YLR288C 1425 nt5.46□□□□□ -1.54
CIK1Q01649 YNL095CYNL095C 1929 nt5.46□□□□□ -1.54
CIK1Q01649 MCM3YEL032W 2916 nt5.46□□□□□ -1.54
CIK1Q01649 BUD14YAR014C 2130 nt5.45□□□□□ -1.54
CIK1Q01649 ICL1YER065C 1674 nt5.45□□□□□ -1.54
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